Un nouveau test pour identifier les souches bactériologiques responsables des méningites

L’apparition de la méningite est souvent rapide et sévère, en particulier quand une infection bactérienne en est la cause. Les dernières recherches pourraient accélérer le diagnostic, menant à de meilleurs résultats pour les patients.

« La méningite est une infection potentiellement très dangereuse extrêmement virulente. Le type d’antibiotique utilisé pour la traiter dépend de la souche de méningite, il est donc essentiel d’identifier le plus rapidement possible », a déclaré Dr Karen Faulds, directrice de l’étude, qui travaille dans le département de chimie appliquée de Strathclyde.

Plusieurs types de bactéries causent la méningite et chacune est sensible à différents antibiotiques. Le Dr Faulds et le PhD Kirsten Gracie, du Centre pour Nanométrologie moléculaire à Strathclyde ont utilisé une technique d’imagerie spectroscopique, la SERS (Diffusion Raman exaltée par effet de surface) pour identifier les bactéries qui sont présentes dans un seul échantillon, en vue de l’analyse de liquide céphalo-rachidien des patients suspectés d’avoir contracté la méningite.

Cette méthode non destructive d’observation et de caractérisation de la composition moléculaire et de la structure externe d’un matériau, exploite le phénomène physique selon lequel un milieu modifie légèrement la fréquence de la lumière y circulant. Ce décalage en fréquence correspond à un échange d’énergie entre le rayon lumineux et le milieu, et donne des informations sur le substrat lui-même. « Le grand avantage de la SERS est qu’il donne des signaux reconnaissables et pointus, qui permettent de discriminer plus facilement les analytes ou substances chimiques présentes dans un mélange », a déclaré le Dr Faulds.

Une série de sondes d’ADN, contenant des colorants détectables par SERS, a permis de distinguer trois types différents agents pathogènes : Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae et Neisseria meningitidisis. Plus le type de bactéries peut être identifié par analyse de l’ADN, plus les patients peuvent recevoir rapidement l’antibiotique le plus efficace pour leur situation.

Ceci réduit également le besoin d’antibiotiques à large spectre, dont l’utilisation excessive a conduit à l’augmentation de résistance des bactéries. La combinaison de la technique de la SERS avec chimiométrie – extraction pilotée par les données de l’information des systèmes chimiques – permet de mesurer la quantité de bactéries dans un échantillon tout en identifiant simultanément les souches. Le travail de chimiométrie a été réalisé en collaboration avec le professeur Roy Goodacre de l’Université de Manchester.

Les chercheurs pensent que le nouveau test serait particulièrement utile lors des co-infections par plusieurs espèces. L’identification de l’agent pathogène dominant présent permettrait alors un traitement plus ciblé.

http://pubs.rsc.org/en/Content/ArticleLanding/2014/SC/c3sc52875h#!divAbstract